| 1987 | Orgelmessen | Joseph Haydn; Wiener Sängerknaben, Chorus Viennensis, Martin Haselböck, Wiener Symphoniker, Uwe Christian Harrer | | 1 |
| 1988 | Poulenc: Organ Concerto / Casella: Concerto Romano | Poulenc, Casella; Martin Haselböck, ORF-Symphonieorchester, Leif Segerstam | | 1 |
| 1989 | Symphonies Nos. 94 "Paukenschlag", 73 "La Chasse", 30 "Alleluja" | Joseph Haydn; Wiener Akademie, Martin Haselböck | | 1 |
| 1991 | Die Freimaurermusiken | Mozart; Wiener Akademie, Martin Haselböck | | 1 |
| 1993 | Variationen und Fuge über ein Originalthema, op. 73 / Fantasie über den Choral "Wachet auf, ruft uns die Stimme", op. 52/2 | Max Reger; Martin Haselböck | | 1 |
| 1995 | Bläserkonzerte / Symphonie "Il grillo" | Telemann; Wiener Akademie, Martin Haselböck | | 1 |
| 1995 | Brandenburgische Konzerte 2-5 | Johann Sebastian Bach; Martin Haselböck & Wiener Akademie | | 1 |
| 1995 | Organ Concertos / Suite for Mechanical Organ | Paul Hindemith; Martin Haselböck, Wiener Symphoniker, Rafael Frühbeck de Burgos | | 1 |
| 1997 | Missa Corporis Christi / Motets | Johann Joseph Fux; Cordier, Minter, Chum, Mertens, Wiener Akademie, Martin Haselböck | | 1 |
| 1998 | Sacred Works | Leopold I; Wiener Akademie, Martin Haselböck | | 1 |
| 2000 | Organ Works, Volume 1: Apparatus musico-organisticus, part I | Georg Muffat; Martin Haselböck | | 1 |
| 2000 | Organ Works, Volume 2: Apparatus musico-organisticus, part II | Georg Muffat; Martin Haselböck | | 1 |
| 2000 | Messe Es-Dur | Franz Schubert; Hugo Distler Chor, Wiener Akademie, Martin Haselböck | | 1 |
| 2002 | Messen G-Dur und C-Dur, Deutsche Messe | Franz Schubert; Martin Haselböck, Marcus Creed | | 1 |
| 2003 | The Organ Works | Ernst Krenek; Martin Haselböck, Ernst Kovacic, Jeff von der Schmidt | | 1 |
| 2004 | Concertos for Guitar and Orchestra Nos. 1-2 | Mauro Giuliani; Edoardo Catemario, Wiener Akademie, Martin Haselböck | | 1 |
| 2005 | Concerto for Guitar and Orchestra no. 3 / Gran Quintetto for Guitar and Strings / Variations for Guitar and String Quartet | Mauro Giuliani; Edoardo Catemario, Wiener Akademie, Martin Haselböck | | 1 |
| 2005 | Concertos | Johann Gottlieb Graun; Korol, Sepec, Ghielmi, Wiener Akademie, Martin Haselböck | | 1 |
| 2005 | Kirchensonaten | Mozart; Wiener Akademie, Martin Haselböck | | 1 |
| 2005 | Symphonie Nr. 4 d-Moll (Orgelsymphonie) / Symphonische Variationen F-Dur | Johann von Herbeck; Hamburger Symphoniker, Martin Haselböck | | 1 |
| 2007 | Das Buch mit sieben Siegeln | Franz Schmidt; Eberhard Büchner, Robert Holl, Gabriele Fontana, Margareta Hintermeier, Kurt Azesberger, Robert Holzer, Martin Haselböck, Wiener Singverein, Wiener Symphoniker, Horst Stein | | 1 |
| 2010 | Balladesque Variations | Klaus Feldmann, Martin Haselböck | | 1 |
| 2011 | Dante Symphony / Evocation à la Chapelle Sixtine | Franz Liszt; Orchester Wiener Akademie, Martin Haselböck | | 1 |
| 2012 | Les Préludes / Orpheus / Berg-Symphonie | Franz Liszt; Orchester Wiener Akademie, Martin Haselböck | | 1 |
| 2012 | Hunnenschlacht / Hungaria / Mazeppa | Franz Liszt; Orchester Wiener Akademie, Martin Haselböck | | 1 |
| 2012 | Tasso. Lamento e trionfo / Le Triomphe funèbre du Tasse / Héroïde funèbre / Die Ideale | Franz Liszt; Orchester Wiener Akademie, Martin Haselböck | | 1 |
| 2012 | Prometheus / Festklänge / Hamlet / Von der Wiege bis zum Grabe | Franz Liszt; Orchester Wiener Akademie, Martin Haselböck | | 1 |
| 2013 | Hungarian Rhapsodies | Franz Liszt; Orchester Wiener Akademie, Martin Haselböck | | 1 |
| 2015 | The Sound of Weimar: Schubert-Liszt Transcriptions | Schubert. Liszt; Orchester Wiener Akademie, Martin Haselböck | | 1 |
| 2015 | RESOUND Beethoven, Vol. 2: Symphony 7 / Wellington’s Victory | Beethoven; Orchester Wiener Akademie, Martin Haselböck | | 1 |
| 2016 | RESOUND Beethoven, Vol. 3: Egmont | Beethoven; John Malkovich, Herbert Föttinger, Orchester Wiener Akademie, Martin Haselböck | 4 | 1 |
| 2016 | RESOUND Beethoven, Vol. 4: Symphony 3 "Eroica" & Septet | Beethoven; Orchester Wiener Akademie, Martin Haselböck | | 1 |
| 2016 | Symphonie Concertante Op. 81 / Passacaglie Et Gigue Op. 90 / Sonata Eroica Op. 94 | Joseph Jongen; Christian Schmitt, Deutsche Radio Philharmonie Saarbrücken Kaiserslautern, Martin Haselböck | | 1 |
| 2017 | RESOUND Beethoven, Vol. 5: Symphony 9 | Beethoven; Aikin, Selinger, Davislim, López, Chorus sine nomine, Orchester Wiener Akademie, Martin Haselböck | | 1 |
| 2018 | RESOUND Beethoven, Vol. 7: Symphony 4 & Piano Concerto 4 | Beethoven; Gottlieb Wallisch, Orchester Wiener Akademie, Martin Haselböck | | 2 |
| 2020 | RESOUND Beethoven, Vol. 8: Symphonies 5 & 6 “Pastoral” | Beethoven; Orchester Wiener Akademie, Martin Haselböck | | 2 |
| 2021 | Organ Concertos, op. 4 & op. 7 | Handel; Martin Haselböck, Jeremy Joseph, Orchester Wiener Akademie | | 1 |
| 2022 | Legends of the Saints I | Franz Liszt; Orchester Wiener Akademie, Martin Haselböck, Tomasz Konieczny, Stéphanie Houtzeel, Chorus Ad Libitum, Chorus Viennensis | | 1 |
| 2023 | Orchestral Songs | Franz Liszt; Thomas Hampson, Sunhae Im, Stéphanie Houtzeel, Tomasz Konieczny, Wiener Akademie, Martin Haselböck | | 1 |
| 2023 | Chopin - Piano Concertos Nos. 1 & 2 | Fryderyk Chopin, Margarita Höhenrieder, Wiener Akademie, Martin Haselböck, Orchestra La Scintilla & Riccardo Minasi | | 1 |
